基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测

CAS OpenIR > 中科院上海应用物理研究所2011-2020年

	基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测
	葛志磊; 裴昊; 王丽华; 宋世平; 樊春海
	2011
Source Publication	中国科学:化学
ISSN	1674-7224
Issue	10 Pages:1666
Abstract	单碱基多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)一直以来被认为可以作为疾病诊断的有效标记,所以这方面的研究一直备受关注.现有的检测方法多在均相体系中进行.相比较而言,在界面上如果能方便快捷地区分SNP,此方法在医疗检测方面的应用性就可以大为加强.我们成功地利用DNA自组装技术在金电极表面组装了四面体结构的DNA纳米结构探针(tetrahedron structure probes,TSPs),有效地控制界面上DNA组装的密度,使得基于四面体结构的DNA探针的杂交行为更接近于溶液相体系,进而实现了在原有界面上受限于异相反应而无法较好完成的SNP分型检测.在TSP和作为信号分子的reporter DNA之间只有6个互补配对碱基的条件下,就可以得到大于10倍的信噪比.相对地,在传统的单链DNA组装上6个碱基的作用力不足以实现良好的信噪比.同时,基于TSP的金电极组装模式由于较厚的四面体组装层所得到的有效空间,更利于DNA杂交反应以及复杂结构的形成.我们使用了Y-支状的DNA杂交策略分别在TSP和单链上做了对比,发现TSP能非常好地区分SNP,而传统单链上在Y-支状DNA杂交策略的条件下区分度就非常有限.这两点都充分地体现了TSP更接近于溶液相体系的优越性,这种三维DNA探针的优越性为我们研究和应用DNA纳米技术在界面反应提供了新的可能.
Keyword	金电极四面体 Dna纳米结构单碱基多态性
Indexed By	CNKI
Language	中文
Funding Project	应物所项目组
Document Type	期刊论文
Identifier	http://ir.sinap.ac.cn/handle/331007/12571
Collection	中科院上海应用物理研究所2011-2020年
Recommended Citation GB/T 7714	葛志磊,裴昊,王丽华,等. 基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测[J]. 中国科学:化学,2011(10):1666.
APA	葛志磊,裴昊,王丽华,宋世平,&樊春海.(2011).基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测.中国科学:化学(10),1666.
MLA	葛志磊,et al."基于三维DNA纳米结构的电化学SNP检测".中国科学:化学 .10(2011):1666.

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